就業(yè)協(xié)議和勞動合同都是具有法律意義的法律文件，兩者緊密相聯(lián)，分別簽訂于畢業(yè)生就業(yè)過程的不同階段。就業(yè)協(xié)議書與勞動合同都是用人單位錄用畢業(yè)生時所訂立的書面協(xié)議，但兩者還是有區(qū)別的，主要表現(xiàn)在：

（1）法律依據(jù)不同：就業(yè)協(xié)議的依據(jù)是1983年3月2日教育部頒布的《高等學校畢業(yè)生分配制度改革方案》和1997年國家教委制定的《普通高等學校畢業(yè)生就業(yè)工作暫行規(guī)定》，而勞動合同則依據(jù)于1995年實施的《勞動法》。前者屬于部頒規(guī)章，后者屬于國家基本法律，部門規(guī)章的法律效力低于國家勞動基本法律。

（2）簽訂內(nèi)容不同：就業(yè)協(xié)議書主要是畢業(yè)生和單位的工作約定。勞動合同是學生和單位的從事具體工作和享受何種待遇等權(quán)利和義務(wù)的約定，內(nèi)容更為具體，勞動權(quán)利義務(wù)更為明確；

（3）簽訂時間不同：一般來說就業(yè)協(xié)議書簽訂在先，勞動合同簽訂在后（一般是學生到單位報到后）。如果畢業(yè)生與用人單位就工資待遇、住房等有事先約定，亦可在就業(yè)協(xié)議書備注條款中予以注明，日后訂立勞動合同對此內(nèi)容應(yīng)予認可；

（4）簽訂目的不同：就業(yè)協(xié)議書是對畢業(yè)生就業(yè)基本情況的認定，是確定學生工作意向、用人單位愿意接收、學校編制就業(yè)計劃和負責畢業(yè)生派遣的依據(jù)。勞動合同是勞動者和用人單位明確勞動關(guān)系中權(quán)利義務(wù)關(guān)系的協(xié)議；

（5）簽訂主體不同：就業(yè)協(xié)議書經(jīng)畢業(yè)生和用人單位簽字蓋章即具有法律效力，學校簽證后列入就業(yè)方案；勞動合同時畢業(yè)生與用人單位簽訂的協(xié)議，學校不是勞動合同的主體，也不是勞動合同的鑒證方。

（6）時效性不同：就業(yè)協(xié)議的效力始于簽訂之日，終于學生到工作崗位報到之時。就業(yè)協(xié)議的作用僅限于對學生就業(yè)過程的約定，一旦畢業(yè)生到用人單位報到，就業(yè)協(xié)議的使命也就完成了。就業(yè)協(xié)議不能替代勞動合同，不是確定勞動關(guān)系的憑證。

協(xié)議書與勞動合同的聯(lián)系在于：就業(yè)協(xié)議書主要是畢業(yè)生和單位的工作約定。但可以在備注中就服務(wù)期、試用期、基本收入、福利、違約金等涉及勞動關(guān)系存續(xù)期間的權(quán)利義務(wù)進行約定；就業(yè)協(xié)議書有關(guān)服務(wù)期、試用期、基本收入、福利、違約金等，在畢業(yè)生到單位報到后，可以作為雙方訂立勞動合同的依據(jù)，但這些條款必須有列入勞動合同，在雙方都認可后，正式簽訂勞動合同，才可以繼續(xù)生效。